Kehittäjät ovat kovaa vauhtia luomassa avoimen koodin sovelluksia .NETiin. Yksi näistä, Mono Project, tarjoaa monia samoja rajapintoja kuin .NET. Kun projekti tulee tiensä päähän ensi vuonna, kehittäjät voivat luoda .NET-sovelluksia Linuxille ja Unixille.

Yksi tunnetuimmista avoimen ohjelmakehityksen johtajista, Bruce Perens, on kuitenkin huolissaan patenttihakemuksista. Hänen mukaansa Microsoft on huolellisesti patentoimassa kaikki .NET-rajapinnat. Tämä estää avointa ohjelmakehitystä tulemasta mukaan .NET-kehitykseen, Perens väittää.

On kuitenkin epäselvää, miten patenttihakemukset vaikuttavat standardointiprosesseihin. Microsoft on jo toimittanut useita .NETin toiminnan periaatteita standardointijärjestö ECMA:lle. Www-maailmaa standardoiva W3C pitää puolestaan ennenaikaisena kommentoida hakemuksia, koska Microsoftin tarkoista suunnitelmista ei ole tietoa.